Il liofilizzatore industriale per la lavorazione degli alimenti è diviso in due strutture principali: tipo batch e tipo completamente continuo; tutti i liofilizzatori da banco- appartengono ad apparecchiature di liofilizzazione per piccoli lotti solo per campioni di prova di laboratorio alimentare.
Il liofilizzatore sottovuoto batch carica tutte le materie prime alimentari prima di avviare un ciclo completo di liofilizzazione-, tutti i vassoi completano la liofilizzazione in modo sincrono, adatto per le fabbriche alimentari che producono più lotti diversi di frutta, carne ed erbe ogni singolo giorno.
Il liofilizzatore industriale continuo realizza l'alimentazione e lo scarico automatici senza arrestare l'intero sistema di liofilizzazione-, abbinando perfettamente le fabbriche che lavorano una singola materia prima con una produzione alimentare giornaliera superiore al livello di tonnellate.
La liofilizzazione batch ha costi di approvvigionamento una tantum inferiori- e occupa meno spazio, ideale per fabbriche alimentari di medie e piccole dimensioni che producono frutta liofilizzata-diversa, snack a base di carne e condimenti a base di erbe.
Il liofilizzatore industriale continuo supporta operazioni di liofilizzazione continua 24-ore-stop con una capacità di lavorazione in un solo giorno molto più elevata-, ampiamente adottato da grandi gruppi integrati di lavorazione profonda di frutta, acqua e carne.
I proprietari delle fabbriche alimentari devono calcolare la produzione giornaliera di materie prime e le categorie di prodotti prima di scegliere il liofilizzatore batch o continuo, evitando modelli di liofilizzatore sottovuoto non corrispondenti che portano a una capacità di produzione giornaliera insufficiente.
